Per i pin dei led che tu li abbi collegati o meno non centra, per quelli dell'accensione se in qualche modo li hai in corto, cioè come se fosse sempre premuto il tasto di accensione potrebbe essere, dai un'occhiata al bios, dove si trova la voce ACPI Function ch è nella sezione Power Management Setup, averla su enabled, se così non fosse abiliti la voce ma dopo devi riformattare, qui un link sui parametri del bios:
http://www.dinoxpc.com/Guide/BIOS/bios/biosGuide.aspal limite nell'ultima voce a destra, dovresti avere qualcosa come load bios default, applicando quella rimetti i parametri di default appunto.