Come già detto dipende dalle impostazioni di Windows per la sicurezza del sistema, quando viene eseguito un programma esterno a quello in uso, e anche per questo ci sarà un avviso di sistema, la protezione fa comparire quella finestra, a meno di non disattivare quella protezione manualmente su ogni computer.
Se ci fosse un modo per disattivare quella finestra potrebbero utilizzarla anche i programmi pericolosi, e pertanto non e possibile.
Metti nella pagina web, una pagina di avviso prima di far aprire il menu principale, con tanto di immagine e di pulsante da cliccare che si presenta quando si avvia la tale applicazione.
Per quanto riguarda la pagina web, forse può interessarti questo programma per compilarla in un unico file eseguibile
http://www.aiutamici.com/software/view.asp?tipo=home&CodSw=1319
Collaboratore Aiutamici