Ciao trespass, la modalita provvisoria non c'entra nulla con la connessione a internet anzi la rende impossibile.
Leggi questo articolo a riguardo:
http://www.aiutamici.com/software/view.asp?tipo=home&CodSw=344&SH=NI programmi come l'antivirus e i vari anti spyware antitrojan ecc... vanno fatti girare in modalita provvisoria quando il pc è già infettato e quindi necessita di essere avviato al minimo per impedire a questi programmi malevoli di caricarsi insieme a windows.
Per quanto riguarda i controlli periodici di routine li puoi fare tranquillamente in modalita normale (sconnetendosi da internet).
Quindi non esiste uno migliore deell'altro perche si usano in situazioni diverse.