Se non sei pratico, puoi fare un'altra prova, tanto per diagnosticare il problema :
Puoi fermare -o rallentare-
delicatamente e molto brevemente ogni ventola (almeno quelle facilmente accessibili) applicando una lieve pressione con l'indice
sulla parte centrale* della ventola, cosi da individuare l'eventuale colpevole. O perlomeno di ridurre la lista dei sospettati.
* Da quello che dici (scheda sotto alla ventola grande) potrebbe essere la ventola della scheda grafica a fare rumore.
La prova indicata sopra è valida, a patto che codesta ventola sia accessibile senza rischio.
Il rumore sembra tipico di un difetto di lubrificazione. Difficile dirti in questo caso cosa fare per rimediare, se come l'hai onestamente ammesso, non te la senti di fare qualche intervento più spinto. Danni per adesso non ne fà, ma oltre al disaggio acustico, bisogna preventivare a medio\lungo termine un peggioramento "meccanico", con rischio di guasto più grave.
Insomma, tornando in tema aeronautico, ti consiglio un saggio appontaggio da qualche tecnico, onde evitare futuri problemi:
http://www.youtube.com/watch?v=zByPa5jN3V4&feature=related