Non basta cambiare lettera alla partizione o all'HD per far si che sopra ci stia il sistema operativo, il BIOS cercherà sempre sul primari master il boot per far partire il sistema, il secondo HD da 20 GB sara sicuramente come slave o come secondario.
Aldilà di tutto ti consiglio di scambiare i due HD e reinstallare ex novo il so sull'HD da 20 GB, e mettere quello da 6,5 come secondario, salvare i dati che ti interessano e tenerlo come souvenir, visto la poca capienza (ormai se non hai un HD da 120 GB non sei nessuno <img src=icon_smile_big.gif border=0 align=middle><img src=icon_smile_big.gif border=0 align=middle>)
Ciao