Ciao, elimina quello che ha trovato Malwarebytes, vedo che il problema avviene con giochi o programmi
a schermo intero, oltre alle infezioni potrebbe trattarsi della scheda video, hai provato ad aggiornare i driver ?

Ciao,
ho aggiornato i drivers ed eliminato ciò che ha trovato Malwarebytes.

Ora post il log aggionato di Hijack:

Logfile of Trend Micro HijackThis v2.0.2
Scan saved at 8.46.21, on 09/04/2010
Platform: Windows Vista SP1 (WinNT 6.00.1905)
MSIE: Internet Explorer v7.00 (7.00.6001.18444)
Boot mode: Normal

Running processes:
C:\Windows\system32\Dwm.exe
C:\Windows\Explorer.EXE
C:\Windows\system32\taskeng.exe
C:\Program Files\Windows Defender\MSASCui.exe
C:\Windows\RtHDVCpl.exe
C:\Acer\Empowering Technology\SysMonitor.exe
C:\Acer\Empowering Technology\eDataSecurity\eDSloader.exe
C:\Program Files\AVAST\ashDisp.exe
C:\Program Files\Microsoft Xbox 360 Accessories\XBoxStat.exe
C:\Program Files\Java\jre6\bin\jusched.exe
D:\PROGRAMMI\SICUREZZA\ClamWin\bin\ClamTray.exe
C:\Windows\ehome\ehtray.exe
C:\Program Files\MASTERIZZAZIONE\Daemon Tools Lite 4.12\daemon.exe
C:\Program Files\Packard Bell\Packard Bell Software Suite\Launcher.exe
C:\Program Files\P2P\eMule\emule.exe
C:\Program Files\Acer Arcade Live\Acer HomeMedia Connect\Kernel\DMS\PCMMediaSharing.exe
C:\Windows\System\w98eject.exe
C:\Windows\ehome\ehmsas.exe
C:\Acer\Empowering Technology\ACER.EMPOWERING.FRAMEWORK.SUPERVISOR.EXE
C:\Acer\Empowering Technology\eRecovery\ERAGENT.EXE
C:\Windows\System32\mobsync.exe
C:\Windows\system32\rundll32.exe
C:\Program Files\Packard Bell\Packard Bell Software Suite\PowerSave\PowerSave.exe
C:\Windows\system32\wuauclt.exe
C:\Program Files\uTorrent\uTorrent.exe
C:\Windows\system32\conime.exe
C:\Windows\system32\SearchFilterHost.exe
C:\Program Files\Trend Micro\HijackThis\HijackThis.exe

R0 - HKCU\Software\Microsoft\Internet Explorer\Main,Start Page = http://www.tiscali.it/
R1 - HKLM\Software\Microsoft\Internet Explorer\Main,Default_Page_URL = http://go.microsoft.com/fwlink/?LinkId=69157
R1 - HKLM\Software\Microsoft\Internet Explorer\Main,Default_Search_URL = http://go.microsoft.com/fwlink/?LinkId=54896
R1 - HKLM\Software\Microsoft\Internet Explorer\Main,Search Page = http://go.microsoft.com/fwlink/?LinkId=54896
R0 - HKLM\Software\Microsoft\Internet Explorer\Main,Start Page = http://it.yahoo.com
R0 - HKCU\Software\Microsoft\Internet Explorer\Main,Local Page =
R0 - HKCU\Software\Microsoft\Internet Explorer\Toolbar,LinksFolderName =
R3 - URLSearchHook: Yahoo! Toolbar - {EF99BD32-C1FB-11D2-892F-0090271D4F88} - (no file)
O1 - Hosts: ::1 localhost
O2 - BHO: Adobe PDF Reader Link Helper - {06849E9F-C8D7-4D59-B87D-784B7D6BE0B3} - C:\Program Files\Adobe\Acrobat 7.0\ActiveX\AcroIEHelper.dll
O2 - BHO: Guida per l'accesso a Windows Live - {9030D464-4C02-4ABF-8ECC-5164760863C6} - C:\Program Files\Common Files\Microsoft Shared\Windows Live\WindowsLiveLogin.dll
O2 - BHO: Windows Live Toolbar Helper - {BDBD1DAD-C946-4A17-ADC1-64B5B4FF55D0} - C:\Program Files\Windows Live Toolbar\msntb.dll
O2 - BHO: Java(tm) Plug-In 2 SSV Helper - {DBC80044-A445-435b-BC74-9C25C1C588A9} - C:\Program Files\Java\jre6\bin\jp2ssv.dll
O3 - Toolbar: Acer eDataSecurity Management - {5CBE3B7C-1E47-477e-A7DD-396DB0476E29} - C:\Windows\system32\eDStoolbar.dll
O3 - Toolbar: Windows Live Toolbar - {BDAD1DAD-C946-4A17-ADC1-64B5B4FF55D0} - C:\Program Files\Windows Live Toolbar\msntb.dll
O4 - HKLM\..\Run: [Windows Defender] %ProgramFiles%\Windows Defender\MSASCui.exe -hide
O4 - HKLM\..\Run: [RtHDVCpl] RtHDVCpl.exe
O4 - HKLM\..\Run: [Acer Empowering Technology Monitor] C:\Acer\Empowering Technology\SysMonitor.exe
O4 - HKLM\..\Run: [eDataSecurity Loader] C:\Acer\Empowering Technology\eDataSecurity\eDSloader.exe
O4 - HKLM\..\Run: [WarReg_PopUp] C:\Acer\WR_PopUp\WarReg_PopUp.exe
O4 - HKLM\..\Run: [Acer Tour Reminder] C:\Acer\AcerTour\Reminder.exe
O4 - HKLM\..\Run: [avast!] C:\PROGRA~1\AVAST\ashDisp.exe
O4 - HKLM\..\Run: [XboxStat] "C:\Program Files\Microsoft Xbox 360 Accessories\XboxStat.exe" silentrun
O4 - HKLM\..\Run: [SunJavaUpdateSched] "C:\Program Files\Java\jre6\bin\jusched.exe"
O4 - HKLM\..\Run: [ClamWin] "D:\PROGRAMMI\SICUREZZA\ClamWin\bin\ClamTray.exe" --logon
O4 - HKCU\..\Run: [Sidebar] C:\Program Files\Windows Sidebar\sidebar.exe /autoRun
O4 - HKCU\..\Run: [ehTray.exe] C:\Windows\ehome\ehTray.exe
O4 - HKCU\..\Run: [DAEMON Tools Lite] "C:\Program Files\MASTERIZZAZIONE\Daemon Tools Lite 4.12\daemon.exe" -autorun
O4 - HKCU\..\Run: [Packard Bell Software Suite] C:\Program Files\Packard Bell\Packard Bell Software Suite\Launcher.exe /run
O4 - HKCU\..\Run: [eMuleAutoStart] C:\Program Files\P2P\eMule\emule.exe -AutoStart
O4 - HKUS\S-1-5-18\..\Run: [msnmsgr] "C:\Program Files\Windows Live\Messenger\msnmsgr.exe" /background (User 'SYSTEM')
O4 - HKUS\.DEFAULT\..\Run: [msnmsgr] "C:\Program Files\Windows Live\Messenger\msnmsgr.exe" /background (User 'Default user')
O4 - Global Startup: Empowering Technology Launcher.lnk = ?
O4 - Global Startup: PCM Media Sharing.lnk = C:\Program Files\Acer Arcade Live\Acer HomeMedia Connect\Kernel\DMS\PCMMediaSharing.exe
O4 - Global Startup: w98Eject.lnk = ?
O8 - Extra context menu item: &Windows Live Search - res://C:\Program Files\Windows Live Toolbar\msntb.dll/search.htm
O8 - Extra context menu item: Add to Windows &Live Favorites - http://favorites.live.com/quickadd.aspx
O8 - Extra context menu item: E&sporta in Microsoft Excel - res://C:\PROGRA~1\MICROS~2\Office12\EXCEL.EXE/3000
O9 - Extra button: Invia a OneNote - {2670000A-7350-4f3c-8081-5663EE0C6C49} - C:\PROGRA~1\MICROS~2\Office12\ONBttnIE.dll
O9 - Extra 'Tools' menuitem: I&nvia a OneNote - {2670000A-7350-4f3c-8081-5663EE0C6C49} - C:\PROGRA~1\MICROS~2\Office12\ONBttnIE.dll
O9 - Extra button: Research - {92780B25-18CC-41C8-B9BE-3C9C571A8263} - C:\PROGRA~1\MICROS~2\Office12\REFIEBAR.DLL
O9 - Extra button: Organizzatore ricerche - {9455301C-CF6B-11D3-A266-00C04F689C50} - C:\Program Files\Common Files\Microsoft Shared\Encarta Researcher\EROPROJ.DLL
O9 - Extra button: PPLive - {95B3F550-91C4-4627-BCC4-521288C52977} - L:\Programmi\PPLive\PPLive.exe
O9 - Extra 'Tools' menuitem: PPLive - {95B3F550-91C4-4627-BCC4-521288C52977} - L:\Programmi\PPLive\PPLive.exe
O9 - Extra button: (no name) - {B205A35E-1FC4-4CE3-818B-899DBBB3388C} - C:\Program Files\Common Files\Microsoft Shared\Encarta Search Bar\ENCSBAR.DLL
O18 - Protocol: skype4com - {FFC8B962-9B40-4DFF-9458-1830C7DD7F5D} - C:\PROGRA~1\COMMON~1\Skype\SKYPE4~1.DLL
O23 - Service: Acer HomeMedia Connect Service - CyberLink - C:\Program Files\Acer Arcade Live\Acer HomeMedia Connect\Kernel\DMS\CLMSServer.exe
O23 - Service: ePerformance Service (AcerMemUsageCheckService) - Unknown owner - C:\Acer\Empowering Technology\ePerformance\MemCheck.exe
O23 - Service: avast! iAVS4 Control Service (aswUpdSv) - ALWIL Software - C:\Program Files\AVAST\aswUpdSv.exe
O23 - Service: Ati External Event Utility - ATI Technologies Inc. - C:\Windows\system32\Ati2evxx.exe
O23 - Service: avast! Antivirus - ALWIL Software - C:\Program Files\AVAST\ashServ.exe
O23 - Service: avast! Mail Scanner - ALWIL Software - C:\Program Files\AVAST\ashMaiSv.exe
O23 - Service: avast! Web Scanner - ALWIL Software - C:\Program Files\AVAST\ashWebSv.exe
O23 - Service: eDSService.exe (eDataSecurity Service) - HiTRSUT - C:\Acer\Empowering Technology\eDataSecurity\eDSService.exe
O23 - Service: eRecovery Service (eRecoveryService) - Acer Inc. - C:\Acer\Empowering Technology\eRecovery\eRecoveryService.exe
O23 - Service: FLEXnet Licensing Service - Acresso Software Inc. - C:\Program Files\Common Files\Macrovision Shared\FLEXnet Publisher\FNPLicensingService.exe
O23 - Service: LightScribeService Direct Disc Labeling Service (LightScribeService) - Hewlett-Packard Company - C:\Program Files\Common Files\LightScribe\LSSrvc.exe
O23 - Service: NVIDIA Display Driver Service (nvsvc) - NVIDIA Corporation - C:\Windows\system32\nvvsvc.exe
O23 - Service: Macrium Reflect Image Mounting Service (ReflectService) - Unknown owner - C:\Program Files\Macrium\Reflect\ReflectService.exe
O23 - Service: Cyberlink RichVideo Service(CRVS) (RichVideo) - Unknown owner - C:\Program Files\CyberLink\Shared Files\RichVideo.exe
O23 - Service: SBSD Security Center Service (SBSDWSCService) - Safer Networking Ltd. - D:\PROGRAMMI\SICUREZZA\Spybot - Search & Destroy\SDWinSec.exe
O23 - Service: Packard Bell Software Suite Service 1 (Service1) - Packard Bell Services - C:\Program Files\Packard Bell\Packard Bell Software Suite\PowerSave\HDPBSSS.exe
O23 - Service: Steam Client Service - Unknown owner - C:\Program Files\Common Files\Steam\SteamService.exe (file missing)
O23 - Service: NVIDIA Stereoscopic 3D Driver Service (Stereo Service) - NVIDIA Corporation - C:\Program Files\NVIDIA Corporation\3D Vision\nvSCPAPISvr.exe

--
End of file - 8560 bytes

Ciao,
ho rivviato dopo aver disinstallato Clamwin e il problema sembrava essere sparito, ma dopo un secondo riavvio il problema si è ripresentato.
Ho installato Avast 5 ed ora sto facendo una scansione completa per sicurezza (ci vorranno moltissime ore).
Quando ho fatto la scansione con findykill, ho collegatto tutti gli hd esterni tranne due chiavette, che però non uso da mesi.
L' autorun.inf che findykill non ha eliminato, appartiene al disco originale di Halo 2. Vuol dire che devo buttarlo via perchè si è infettato?
Grazie per l'aiuto

Per "che lavora a schermo intero" intendo i programmi che quando lavorano non appaiono come una finestra di windows, ma riempono tutto lo schermo. Per esempio, quando usi un player e fai doppio click per allargare a full screen.
Per essere più chiaro: un gioco se funziona in modalità finestra non mi da problemi, mentre se, come la maggior parte di dei giochi, funziona a tutto schermo mi si chiude.
ciao

Ho disinstallato gli antispy che avevo installato, ma non ho capito cosa devo fare con windefender; se non sbaglio, non è il firewall di windows? Devo disinstallarlo?
Per quanto riguarda la scheda grafica, ne ho due. Un'ati integrata che non uso e una nvidia che ho montato successivamente. Per caso avrei dovuto disattivare l'ati dopo aver montato l'nvidia?
Oltre a programmi e giochi che si chiudono, il contorno delle finestre di windows cambia di colore ogni 10 secondi circa. Per un istante diventano quasi bianche come quando si blocca un programma e appare la scritta "l'applicazione non risponde". Nello stesso momento l'utilizzo dalla cpu sale al 100%.

windows defender è(credo,non l ho mai usato)un antispyware in tempo reale.io sono del parere che su un pc vada installato un antivirus(avast nel tuo caso)un firewall(ed hai quello di windows che in vista,contrariamente ad xp,va bene)ed un antispyware(e nel tuo caso sempre avast che svolge questa funzione).non so con certezza se possa entrare in conflitto con windows defender,ma nel dubbio eliminerei quest ultimo in quanto,in ogni caso,superfluo.
per cio' che riguarda la scheda grafica non so se dovevi disattivare quella integrata,posso dirti cio' che farei io:disattiverei la nvidia,cosi' da poter escludere,in caso di persistenza dei problemi,che sia lei la causa.in ogni caso prova ad aprire il taskmanager,e quando vedi la cpu che schizza alle stelle guarda quali programmi sono i responsabili.

Avvia hijackthis, metti la spunta alle voci che andrò ad elencarti e con tutte le applicazioni chiuse e disconnesso da Internet,premi su fix checked
O4 - HKCU\..\Run: [eMuleAutoStart] C:\Program Files\P2P\eMule\emule.exe -AutoStart
O4 - HKUS\S-1-5-18\..\Run: [msnmsgr] "C:\Program Files\Windows Live\Messenger\msnmsgr.exe" /background (User 'SYSTEM')
O4 - HKUS\.DEFAULT\..\Run: [msnmsgr] "C:\Program Files\Windows Live\Messenger\msnmsgr.exe" /background (User 'Default user')
O4 - Global Startup: Empowering Technology Launcher.lnk = ?
O4 - Global Startup: PCM Media Sharing.lnk = C:\Program Files\Acer Arcade Live\Acer HomeMedia Connect\Kernel\DMS\PCMMediaSharing.exe
O4 - Global Startup: w98Eject.lnk = ?

Dai una pulita (registro compreso)con CCleaner: http://www.aiutamici.com/software?ID=11223
Nella schermata iniziale di CCleaner, clicca su Opzioni e poi Avanzate, togli il segno di spunta a: Cancella i file in Windows Temp solo se più vecchi di 48 ore. (poi esegui le pulizie)

Riavvia il pc.
Controlla la CPU.
Se risulta alta, posta un nuovo log di HJT.

Seguendo il consiglio di un amico ho disattivato windows aero. Finalmente posso nuovamente usare programmi e giochi senza che si chiudano dopo 10 secondi.
La scansione di avast non segnala alcun problema. L'unico problema rimasto è l'aumento dell'utilizzo della cpu, anche se ora sale, sempre a picchi, dal 7%(circa) a 60%(circa).

esegui le operazioni che ti ha indicato r16,e vedrai che scendera' ulteriormente.

guarda che ci sarebbe da fare un po di cose,ma se a te sta bene cosi'....