Il pop-up di cui dici (quello riferito alla versione vecchia) si riferisce ad una ben precisa DLL. In effetti, installando ClamMail si ottiene la versione 1.4.4...
La versione attuale, però, è la 1.4.5!
La sola differenza fra le due versioni consiste in una DLL.
La DLL in questione è scaricabile liberamente dal sito di Sourceforge (dalla stessa pagina dalla quale si può scaricare ClamMail).
Se non l'hai già fatto (ma spero di sì), devi scaricare la DLL in questione, salvarla sul tuo computer e poi estrarla dal suo zip.
Dopo di che, vai in Modalità Provvisoria (se non vai il Modalità Provvisoria, l'operazione fallità!) e trasferisci la DLL in questione nella cartella di ClamMail (che si trova a sua volta contenuta dentro a C/Programmi), sovrascrivendo la DLL antecedente.
Fatto ciò, puoi tranquillamente tornare in Modalità Normale.
Vedrai che -molto sporadicamente- seguiterà ad apparirti ancora il messaggio riguardo alla DLL obsoleta (capita, talvolta, quando ClamMail incontra difficoltà a connettersi per l'aggiornamento), ma molto raramente.
Se la DLL sai già di averla aggiornata, puoi andare tranquillo: è tutto quanto OK.